Озеро тектонического происхождения, проточное. В него впадают шесть речек, пять ручьев и многочисленные родники на южном берегу озера. Речки: Липовка, Меховая, Бобровка, Кулешовка, Пугачёвка и Крутая. Общий приток воды — около 35 л/с. В восточной части из Тургояка вытекает речка Исток, которая впадает в реку Миасс. Минерализация воды озера не превышает 100 мг/л.[12].
Площадь водной поверхности озера — 26,4 квадратных километра. Средняя глубина — 19,1 метра, максимальная глубина — 36,5 метра. Вода озера имеет высокую прозрачность, которая составляет от 10 до 17,5 метра[11].
Тургояк — в числе самых прозрачных озёр России[13].
Озеро содержит чистейшую природную воду, по качеству близкую к байкальской.